Metody i narzędzia naukowe obejmują książki oraz zagadnienia przydatne w planowaniu, prowadzeniu i opisywaniu badań. Wpisy dotyczą projektowania badań medycznych, doboru próby, metaanalizy, pomiarów terenowych, przygotowania próbek i analizy niepewności. Kategoria przybliża też warsztat publikacyjny, w tym strukturę sekcji Materials and Methods, pomagając świadomie oceniać procedury i wyniki badań.